17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3409 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  31.45 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  36.23 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  32.57 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  33.12 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  29.72 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  26.35 
 
 		 265 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  26.22 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  26.38 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  35.19 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  26.61 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  24.71 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04325  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.98 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  24.32 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  24.32 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1620  hypothetical protein  24.38 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269687  normal  0.0195645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>