15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4259 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  30.11 
 
 
303 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  34.29 
 
 
288 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  31.45 
 
 
303 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  28.85 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  26.22 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  28.35 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  29.69 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  26.22 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  28.19 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  23.61 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  24.71 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3470  hypothetical protein  23.85 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>