15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0917 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  57.28 
 
 
303 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  31.45 
 
 
281 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  29.78 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  28.32 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  27.01 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  30.38 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  27.63 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  29.41 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  29.17 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  30.6 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  30.93 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  25.1 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3470  hypothetical protein  25.73 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>