20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0984 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  33.21 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  31.14 
 
 
303 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  26.35 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  26.86 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1692  hypothetical protein  27.97 
 
 
229 aa  85.9  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  30 
 
 
281 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  29.71 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  26.4 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  27.74 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  30.41 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1355  hypothetical protein  26.21 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04325  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  25.2 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  30.6 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  29.82 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  26.14 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  26.07 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3410  hypothetical protein  26.73 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1620  hypothetical protein  24.4 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269687  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_002950  PG0189  hypothetical protein  24.71 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.776324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>