22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1346 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  57.58 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  45.15 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  33.68 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  38.02 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  31.1 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  29.52 
 
 		 454 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  25.37 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  26.1 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  23.4 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  26.01 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  26.16 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  23.05 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  22.76 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  23.29 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  23.71 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  23.21 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  23.78 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  23.64 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  22.71 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  24.5 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>