15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0540 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  47.04 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  33.6 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  33.68 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  34.15 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  32.51 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  21.64 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  23.28 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  27.43 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  24.08 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  27.03 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  25.11 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  24.39 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  26.67 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  22.7 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>