25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0442 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  100 
 
 		 388 aa  785    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  57.58 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  44.13 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  36.21 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  32.23 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  32.51 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  28.92 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  23.82 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  24.91 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  25.8 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  25.2 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  26.57 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  24.75 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  22.38 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  26.1 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  23.71 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  23.54 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  24.41 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  22.8 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  41.94 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  27.03 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  26.01 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  23.47 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  25.56 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  25.56 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>