16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2005 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  843    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  44.67 
 
 
388 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  41.87 
 
 
437 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  41.73 
 
 
451 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  40.24 
 
 
442 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  39.15 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  32.71 
 
 
435 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  30.63 
 
 
427 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  24.55 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1268  hypothetical protein  24.87 
 
 
461 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0113688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1432  hypothetical protein  23.43 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  22.71 
 
 
454 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  25.37 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  27.27 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  26.1 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  23.79 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>