23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3732 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  100 
 
 		 404 aa  820    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  45.15 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  44.13 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  33.6 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  33.17 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  32.53 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  29.97 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  25.68 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  24.27 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  29.7 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  25.4 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  25.33 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  21.56 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  24.41 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  26.72 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  22.16 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  27.91 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  25.53 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  22.25 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  23.32 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  24.31 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>