13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2505 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  57.65 
 
 
382 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  50.74 
 
 
371 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  48.34 
 
 
359 aa  348  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  47.37 
 
 
358 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  44.92 
 
 
361 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  41.99 
 
 
361 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  27.01 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  27.14 
 
 
455 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  25.8 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  24.41 
 
 
404 aa  59.7  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  24.39 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  23.78 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>