16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0964 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  60.24 
 
 
382 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  52.94 
 
 
359 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  46.33 
 
 
358 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  44.92 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  46.07 
 
 
361 aa  338  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  43.99 
 
 
371 aa  338  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  24.79 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  25.96 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  22.55 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  25.5 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  22.83 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  23.65 
 
 
384 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  23.96 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  22.8 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  20.38 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>