15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2087 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  743    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  51.48 
 
 
382 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  51.49 
 
 
359 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  51.96 
 
 
358 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  46.07 
 
 
361 aa  325  8.000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  44.72 
 
 
371 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  41.99 
 
 
357 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  25.43 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  22.89 
 
 
455 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  22.38 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  22.76 
 
 
384 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  22.25 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  20.21 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  22.47 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  27.74 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>