22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4447 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  940    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  30.37 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  29.52 
 
 
384 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  29.43 
 
 
388 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  25.13 
 
 
382 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  25.38 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  27.01 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  25.15 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  25.14 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  26.56 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  23.21 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  22.19 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  22.64 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  25.78 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  27.23 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  25.45 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  27.38 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  21.97 
 
 
442 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  27.73 
 
 
360 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  23.92 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  24.83 
 
 
344 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  23.1 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>