16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1972 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  741    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  57.06 
 
 
382 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  51.91 
 
 
358 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  51.49 
 
 
361 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  52.94 
 
 
361 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  51.45 
 
 
371 aa  371  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  48.34 
 
 
357 aa  348  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  23.21 
 
 
454 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  24.53 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  24.75 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  25.08 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  23.28 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  22.16 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  23.76 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  23.21 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  26.59 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>