20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4945 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  727    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  47.04 
 
 
360 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  35.52 
 
 
344 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  31.1 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  32.53 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  32.23 
 
 
388 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  24.53 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  26.1 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  24.83 
 
 
454 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  26.48 
 
 
381 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  25.22 
 
 
388 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  24.49 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  38.03 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  38.03 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  25.6 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  25.53 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  23.79 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  21.28 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  27.07 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  22.47 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>