12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0380 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  59.29 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  51.91 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  51.96 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  48.23 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  47.37 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  46.33 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  24.75 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  25.74 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  24.41 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  23.32 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  23.64 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>