13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0066 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1985  hypothetical protein  50.85 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0730316  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  51.45 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2505  hypothetical protein  50.74 
 
 		 357 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0380  hypothetical protein  48.23 
 
 		 358 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124111  normal  0.0430225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0964  hypothetical protein  43.99 
 
 		 361 aa  325  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  44.72 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  23.05 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  25 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3608  hypothetical protein  24.73 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  hitchhiker  0.000266033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  23.54 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  23.71 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  21.28 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>