15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4410 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1268  hypothetical protein  42.24 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0113688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  39.49 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1432  hypothetical protein  36.67 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  30.67 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  30.83 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  28.4 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  28.43 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  26.81 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  27.34 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  25.42 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  27.41 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  22.73 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  27.21 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  24.5 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>