77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  46.25 
 
 		 240 aa  188  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  38.59 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  48.75 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  38.91 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  38.59 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  38.17 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  38.17 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  37.76 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  38.17 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  36.93 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  40.68 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  39.68 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  35.37 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  37.34 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  41.91 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  41.04 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  37.76 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  38 
 
 		 496 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  28.57 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  28.57 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.98 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  29.91 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  29.84 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  29.91 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  24.85 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  29.91 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  35 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.7 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.57 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 785 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  30.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  30.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  26.8 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  26.8 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  26.8 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  30.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  26.83 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  29.03 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  34 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  29 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.62 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.76 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.74 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.92 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.29 
 
 		 284 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 271 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  24.31 
 
 		 282 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>