90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  75 
 
 
253 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  73.41 
 
 
251 aa  358  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  66.27 
 
 
253 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  66.93 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  62.3 
 
 
252 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  68.38 
 
 
253 aa  316  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  61.94 
 
 
252 aa  309  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  59.29 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  54.62 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  55.51 
 
 
496 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  35.12 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  34.68 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
254 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  38.8 
 
 
250 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  34.3 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  33.88 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  33.88 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  34.3 
 
 
253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  33.47 
 
 
253 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  34.08 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  30.61 
 
 
253 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
253 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
240 aa  121  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
260 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  26.56 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  26.14 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  26.25 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  25.62 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  26.47 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  32.69 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.76 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
196 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  26.71 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.64 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.25 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  30.94 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.82 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.82 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.82 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.82 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  30.22 
 
 
309 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 
223 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  31.62 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  26.39 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.17 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  24.89 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.48 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.17 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.29 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2585  hypothetical protein  30.49 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163452  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.73 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.26 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.35 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30.77 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30 
 
 
581 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  30 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
213 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.5 
 
 
244 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.33 
 
 
261 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>