64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0493 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  83.6 
 
 
253 aa  447  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  38.02 
 
 
253 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  37.2 
 
 
253 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  37.2 
 
 
253 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  36.78 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  36.1 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  35.95 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  35.95 
 
 
253 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
254 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
257 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  34.91 
 
 
278 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
253 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.77 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  32.94 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
252 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  30.42 
 
 
250 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 
253 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  29.83 
 
 
496 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  30.21 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  28.64 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  29.73 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  28.35 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  28.35 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  22.34 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.83 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2585  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  25.16 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0796  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.16 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.04 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0374  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.97 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.34 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.03 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1291  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  23.49 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.68 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.96 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.96 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.96 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.96 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.32 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.93 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4129  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.67 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0406276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2586  methyltransferase, putative  27.78 
 
 
151 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.135007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>