51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0758 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  83.6 
 
 
253 aa  447  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  37.96 
 
 
253 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  37.96 
 
 
253 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  39.02 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  39.02 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  38.24 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  37.55 
 
 
253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  37.13 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  37.55 
 
 
253 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  35.65 
 
 
278 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
251 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
257 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.44 
 
 
260 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
253 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
252 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  31.02 
 
 
253 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  32.81 
 
 
252 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
253 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  32.1 
 
 
496 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  32.39 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
257 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  27.09 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  29.9 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  26.91 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  28.11 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  26.8 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  26.8 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  32.95 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0219  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.17 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.49 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  21.32 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  25.5 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2585  hypothetical protein  29.76 
 
 
125 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0796  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.83 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2586  methyltransferase, putative  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.135007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1205  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.38 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.836419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  23.19 
 
 
315 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  22.22 
 
 
315 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 
256 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.51 
 
 
256 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.9 
 
 
240 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.37 
 
 
243 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  24.41 
 
 
274 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>