74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1239 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  526  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  62.6 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  62.45 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  59.29 
 
 
251 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  60.32 
 
 
252 aa  292  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  57.71 
 
 
251 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  56.8 
 
 
252 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  56.75 
 
 
252 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  61.42 
 
 
253 aa  278  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  53.82 
 
 
257 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  49.15 
 
 
496 aa  211  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  34.96 
 
 
252 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  35.39 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  35.92 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
250 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  35.39 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  35.39 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  34.57 
 
 
253 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  35.32 
 
 
253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  34.16 
 
 
253 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  34.4 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  33.06 
 
 
253 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  34.85 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.21 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  25.62 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  24.59 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  25.62 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  24.6 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  24.69 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.21 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  38.38 
 
 
214 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.56 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.87 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  34.74 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.99 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.74 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.69 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.69 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  35.79 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.75 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.42 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.38 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.06 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.2 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.38 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  28.48 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
173 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.03 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.75 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
267 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
278 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
634 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>