56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  100 
 
 
252 aa  500  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  75.3 
 
 
253 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  74.5 
 
 
253 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  70.16 
 
 
252 aa  344  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  70.52 
 
 
251 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  66.93 
 
 
251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  63.35 
 
 
252 aa  318  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  67.86 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  60.32 
 
 
257 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  56.22 
 
 
257 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  56.12 
 
 
496 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  41.77 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  36.33 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  35.1 
 
 
253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  34.98 
 
 
253 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  35.1 
 
 
253 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  34.69 
 
 
253 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  35.1 
 
 
253 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  35.1 
 
 
253 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  34.29 
 
 
253 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
250 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  38.75 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
253 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.63 
 
 
260 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  26.78 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  26.78 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  25.62 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  25.52 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  24.38 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  27.74 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  41.41 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.26 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.79 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.21 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 
207 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  38.24 
 
 
187 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  44.44 
 
 
207 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.44 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
282 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
259 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50 
 
 
256 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
256 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  41.77 
 
 
228 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>