42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  41.84 
 
 
253 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  41.84 
 
 
253 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  41.25 
 
 
254 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  41 
 
 
253 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  41 
 
 
253 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  41.42 
 
 
253 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  39.58 
 
 
253 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  38.98 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  44.06 
 
 
250 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  39.17 
 
 
253 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  36.86 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
253 aa  135  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.68 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  34.91 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  34.24 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
251 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  34.08 
 
 
251 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  36.78 
 
 
252 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  35.27 
 
 
257 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  33.08 
 
 
252 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 
252 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  35.06 
 
 
496 aa  83.2  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  30.32 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  29.03 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  29.03 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  29.68 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  29.68 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2585  hypothetical protein  30.93 
 
 
125 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  24.57 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.75 
 
 
202 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.04 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
199 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
256 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>