53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3525 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3525  Methyltransferase type 11  100 
 
 
253 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0544  Methyltransferase type 11  78.17 
 
 
253 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15300  methyltransferase family protein  74.5 
 
 
252 aa  364  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0087  Methyltransferase type 11  72.33 
 
 
253 aa  344  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1911  methyltransferase type 11  69.05 
 
 
251 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0474  Methyltransferase type 11  67.21 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  0.148822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0060  hypothetical protein  66.27 
 
 
251 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11613  hypothetical protein  61.9 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265697  normal  0.253972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1239  Methyltransferase type 11  62.45 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0387045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0642  methyltransferase type 11  54.76 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02370  methyltransferase family protein  54.51 
 
 
496 aa  230  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3106  methyltransferase domain family  37.94 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2860  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7407  hypothetical protein  39.36 
 
 
252 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1562  Methyltransferase type 11  42.63 
 
 
250 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2159  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2798  methyltransferase  37.15 
 
 
253 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3089  hypothetical protein  36.76 
 
 
253 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2838  methyltransferase  36.36 
 
 
253 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00372219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3081  hypothetical protein  36.91 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2866  hypothetical protein  36.91 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3075  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11170  hypothetical protein  36.86 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00565522  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0493  hypothetical protein  32.79 
 
 
253 aa  131  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0758  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
253 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13990  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.91 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0749  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.531285  normal  0.910776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2548  methyltransferase  25.1 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  26.89 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  26.89 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2388  methyltransferase type 11  25.63 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  25.94 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  24.89 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  23.57 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  35.58 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.58 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  22.86 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  22.86 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  22.86 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.89 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.08 
 
 
331 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
236 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  29.08 
 
 
309 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  28.47 
 
 
214 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>