More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0412 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  95.45 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0408  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  94.43 
 
 		 306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  86.04 
 
 		 308 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3875  Ppx/GppA phosphatase  85.67 
 
 		 308 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3927  Ppx/GppA phosphatase  85.67 
 
 		 308 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  85.99 
 
 		 308 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4068  Ppx/GppA phosphatase  85.34 
 
 		 308 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  70.63 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  71.43 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  70.39 
 
 		 311 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  70.63 
 
 		 303 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0462  Ppx/GppA phosphatase  71.48 
 
 		 313 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  67.88 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3214  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  69.84 
 
 		 305 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.81 
 
 		 497 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.52 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.42 
 
 		 498 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 		 493 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 		 493 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 		 493 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.08 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 		 493 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.24 
 
 		 498 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.24 
 
 		 498 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.24 
 
 		 498 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.21 
 
 		 495 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.05 
 
 		 500 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 		 498 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.54 
 
 		 498 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  44.22 
 
 		 494 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  44.22 
 
 		 494 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 		 494 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 		 509 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 526 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 526 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 526 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 526 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  41.8 
 
 		 505 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 513 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  41.37 
 
 		 501 aa  208  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  40.4 
 
 		 500 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  39.19 
 
 		 516 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  40.39 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  41 
 
 		 503 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  39.16 
 
 		 513 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.83 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  41.02 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.4 
 
 		 501 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  43.02 
 
 		 439 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.83 
 
 		 513 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  39.74 
 
 		 501 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  40.06 
 
 		 506 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  38.49 
 
 		 513 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.67 
 
 		 500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  37.86 
 
 		 511 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  38.56 
 
 		 501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  37.5 
 
 		 509 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 519 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 519 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 519 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  37.54 
 
 		 511 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  39.46 
 
 		 520 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  37.5 
 
 		 502 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  37.66 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  39 
 
 		 508 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.81 
 
 		 506 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  37.95 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  37.95 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 506 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  36.89 
 
 		 508 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.81 
 
 		 501 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.13 
 
 		 499 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 520 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 520 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 520 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 509 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  40.66 
 
 		 499 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  38.89 
 
 		 500 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.89 
 
 		 526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  38.96 
 
 		 500 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  37.54 
 
 		 511 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  37.54 
 
 		 511 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>