More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0408 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0408  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  94.43 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  94.43 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  92.46 
 
 		 308 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  84.92 
 
 		 308 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3875  Ppx/GppA phosphatase  84.59 
 
 		 308 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  85.25 
 
 		 308 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3927  Ppx/GppA phosphatase  84.59 
 
 		 308 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4068  Ppx/GppA phosphatase  84.26 
 
 		 308 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  69.31 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  71.76 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  70.96 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  69.41 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0462  Ppx/GppA phosphatase  69.8 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  66.56 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3214  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  68.52 
 
 		 305 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.16 
 
 		 497 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.93 
 
 		 497 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 		 498 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.95 
 
 		 498 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.85 
 
 		 500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.05 
 
 		 498 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.88 
 
 		 498 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.88 
 
 		 498 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.88 
 
 		 498 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.58 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.58 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.58 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.58 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.58 
 
 		 493 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.36 
 
 		 495 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.67 
 
 		 498 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  232  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  45.02 
 
 		 494 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.22 
 
 		 513 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.22 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.22 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  39.22 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.22 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  39.46 
 
 		 516 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  39.07 
 
 		 500 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  39.14 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.82 
 
 		 513 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  39.6 
 
 		 502 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  38.67 
 
 		 509 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.82 
 
 		 513 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  40.07 
 
 		 501 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  39.34 
 
 		 501 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  43.39 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  39.87 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  38.73 
 
 		 501 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  40.26 
 
 		 503 aa  198  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  37.83 
 
 		 511 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  37.79 
 
 		 513 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  37.5 
 
 		 511 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  37.54 
 
 		 501 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  37.46 
 
 		 509 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  37.58 
 
 		 519 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  39.09 
 
 		 506 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  37.58 
 
 		 519 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  37.58 
 
 		 519 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.02 
 
 		 500 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  40.59 
 
 		 506 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 520 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  37.25 
 
 		 516 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  36.82 
 
 		 517 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  40.59 
 
 		 501 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  36.96 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  38.82 
 
 		 508 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  36.45 
 
 		 508 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  40.66 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  37.26 
 
 		 506 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  36.79 
 
 		 509 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  36.27 
 
 		 502 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 		 508 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  36.88 
 
 		 501 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  35.93 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  38.67 
 
 		 500 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.67 
 
 		 526 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  38.74 
 
 		 500 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  35.59 
 
 		 520 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  35.59 
 
 		 520 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  35.59 
 
 		 520 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  36.79 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>