More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00339 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  91.51 
 
 
439 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  84.82 
 
 
497 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  100 
 
 
497 aa  1014    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  57.64 
 
 
498 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.62 
 
 
498 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.5 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.69 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.69 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.5 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.33 
 
 
495 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.5 
 
 
493 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.85 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.5 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  56.5 
 
 
493 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  55.19 
 
 
494 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.51 
 
 
498 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  55.19 
 
 
494 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.51 
 
 
498 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.51 
 
 
498 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  55.4 
 
 
494 aa  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  45.57 
 
 
503 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  44.85 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  41.51 
 
 
501 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.51 
 
 
501 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  42.38 
 
 
509 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  42.04 
 
 
500 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  41.34 
 
 
513 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  40.98 
 
 
516 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  40.33 
 
 
508 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  40.94 
 
 
526 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
526 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
526 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
526 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
513 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  40.08 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  40.97 
 
 
520 aa  356  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
509 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  40.33 
 
 
513 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  39.92 
 
 
511 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  40.9 
 
 
509 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.92 
 
 
511 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  40.12 
 
 
513 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  40.16 
 
 
506 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  39.92 
 
 
513 aa  349  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.39 
 
 
519 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.39 
 
 
519 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  39.18 
 
 
519 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  38.84 
 
 
516 aa  342  8e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.76 
 
 
501 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  38.48 
 
 
500 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.82 
 
 
526 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
500 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  38.55 
 
 
500 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  39.21 
 
 
508 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  38.03 
 
 
501 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  39.6 
 
 
508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.71 
 
 
500 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  39.42 
 
 
497 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  37.22 
 
 
500 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
500 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  37.22 
 
 
500 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 
499 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  39.86 
 
 
506 aa  315  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  38.74 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 
500 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  38.68 
 
 
506 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  41.38 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  39.07 
 
 
501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 
493 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 
493 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  37.79 
 
 
518 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  38.45 
 
 
505 aa  302  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  36.8 
 
 
505 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  37.3 
 
 
499 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  36.4 
 
 
505 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  37.76 
 
 
518 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 
518 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  39.38 
 
 
517 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  37.3 
 
 
518 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.48 
 
 
502 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  38.9 
 
 
509 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 
520 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  37.53 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  35.23 
 
 
504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  34.45 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  37.28 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>