More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3192 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
308 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.1 
 
 
498 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  50.87 
 
 
497 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  48.12 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.13 
 
 
498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.13 
 
 
498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
494 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.13 
 
 
498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  48.12 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  50.17 
 
 
497 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  48.12 
 
 
498 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.1 
 
 
498 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
495 aa  261  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
493 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.76 
 
 
498 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
493 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
493 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
493 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.4 
 
 
493 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.08 
 
 
500 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  47.67 
 
 
330 aa  254  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  47.75 
 
 
503 aa  248  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  46.98 
 
 
503 aa  242  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  43.3 
 
 
500 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 
439 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  43.45 
 
 
501 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  42.86 
 
 
516 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
509 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.24 
 
 
501 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  38.96 
 
 
500 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  40.89 
 
 
508 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  39.59 
 
 
526 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  40.4 
 
 
501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  39.59 
 
 
513 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  41.58 
 
 
508 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.25 
 
 
526 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.25 
 
 
526 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.25 
 
 
526 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.25 
 
 
513 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.48 
 
 
499 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.03 
 
 
516 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  39.8 
 
 
519 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.26 
 
 
511 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.8 
 
 
519 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.8 
 
 
519 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  39.6 
 
 
511 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  39.31 
 
 
506 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  39.46 
 
 
513 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  36.64 
 
 
520 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  37.67 
 
 
505 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  39.12 
 
 
513 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  36.55 
 
 
517 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  39.25 
 
 
509 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.19 
 
 
506 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  37.76 
 
 
520 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.19 
 
 
501 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.78 
 
 
513 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  38.54 
 
 
508 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.59 
 
 
509 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  37.91 
 
 
500 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  35.5 
 
 
503 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  35.5 
 
 
503 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  36.3 
 
 
520 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  36.3 
 
 
520 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  35.86 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
526 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  38.24 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  35.96 
 
 
520 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  37.79 
 
 
310 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  36.95 
 
 
500 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  39.46 
 
 
308 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0462  Ppx/GppA phosphatase  38.44 
 
 
313 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.34 
 
 
305 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3927  Ppx/GppA phosphatase  39.13 
 
 
308 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3875  Ppx/GppA phosphatase  39.13 
 
 
308 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
500 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  36.27 
 
 
501 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  37.58 
 
 
311 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 
518 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
500 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
499 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 
518 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  36.58 
 
 
506 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
500 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>