More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2946 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  97.85 
 
 		 511 aa  1035    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  82.55 
 
 		 519 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  85.46 
 
 		 509 aa  910    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  74.07 
 
 		 513 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  75.15 
 
 		 513 aa  817    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  82.75 
 
 		 519 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  74.26 
 
 		 513 aa  789    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  73.97 
 
 		 513 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  100 
 
 		 511 aa  1052    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  82.16 
 
 		 516 aa  872    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  73.97 
 
 		 526 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  73.97 
 
 		 526 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  74.46 
 
 		 513 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  73.97 
 
 		 526 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  86.08 
 
 		 509 aa  919    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  73.97 
 
 		 526 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  82.75 
 
 		 519 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  52.54 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  50.6 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  51.2 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  50.2 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  49.69 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  48.61 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  46 
 
 		 509 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  43.06 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  42.12 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.78 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  41.84 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  40 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  41.82 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.09 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  40.52 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.09 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  43.72 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  40.49 
 
 		 500 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  41.03 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.57 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.57 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.57 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  44.04 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  40.79 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  42.94 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  41.18 
 
 		 508 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  44.69 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  41.48 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  44.99 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  41.42 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  40.97 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  39.43 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  41.41 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  42.36 
 
 		 499 aa  345  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.8 
 
 		 498 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  44.17 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  40.69 
 
 		 518 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  38.68 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  43.83 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  43.93 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  39.25 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  43.83 
 
 		 520 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.8 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.8 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  39.48 
 
 		 508 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.92 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.44 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  39.13 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  40.28 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39.39 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  38.99 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  38.99 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.31 
 
 		 495 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.99 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.99 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.44 
 
 		 500 aa  329  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  43.36 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  38.61 
 
 		 511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  38.61 
 
 		 511 aa  326  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  37.82 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.29 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.49 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.29 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  37.62 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  37.7 
 
 		 509 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.29 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>