More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0173 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  100 
 
 
330 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.1 
 
 
497 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.77 
 
 
497 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  44.97 
 
 
503 aa  265  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.74 
 
 
498 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.74 
 
 
498 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.74 
 
 
498 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.05 
 
 
498 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  47.67 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  43.09 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
494 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  43.09 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
495 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.43 
 
 
498 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.52 
 
 
498 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.78 
 
 
498 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.78 
 
 
500 aa  248  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
493 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
493 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
493 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
493 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.09 
 
 
493 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  43.79 
 
 
503 aa  242  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  41.2 
 
 
500 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  39.37 
 
 
508 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.4 
 
 
501 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  39.49 
 
 
501 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  42.52 
 
 
501 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  40.58 
 
 
509 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.7 
 
 
526 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.54 
 
 
513 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.39 
 
 
526 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.39 
 
 
526 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.39 
 
 
526 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  40.07 
 
 
511 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  39.2 
 
 
516 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.74 
 
 
511 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
508 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  39.07 
 
 
509 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  36.62 
 
 
508 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.54 
 
 
513 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.54 
 
 
513 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.07 
 
 
509 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  37.87 
 
 
519 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  36.73 
 
 
520 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  37.87 
 
 
519 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  37.87 
 
 
519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
513 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
520 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  37.75 
 
 
520 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  37.75 
 
 
520 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  43.08 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
520 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
505 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  37.09 
 
 
518 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
517 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  36.63 
 
 
499 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  37.79 
 
 
516 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  36.21 
 
 
502 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  35.44 
 
 
506 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  36.91 
 
 
500 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 
506 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  36.42 
 
 
501 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  39.33 
 
 
311 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  36.83 
 
 
500 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  36.22 
 
 
526 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  37.09 
 
 
500 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  35.76 
 
 
501 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  36.51 
 
 
500 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  36.19 
 
 
500 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  36.19 
 
 
500 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  34.38 
 
 
511 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  37.91 
 
 
509 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  37.91 
 
 
503 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  34.77 
 
 
500 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  35.43 
 
 
508 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  34.38 
 
 
511 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
518 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
518 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  39.07 
 
 
499 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  38 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
518 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
506 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  36.93 
 
 
504 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  34.89 
 
 
506 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  36.93 
 
 
504 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>