More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0294 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  84.8 
 
 
500 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  98.6 
 
 
500 aa  1005    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  100 
 
 
526 aa  1072    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  88.98 
 
 
500 aa  903    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  79.4 
 
 
500 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  75.05 
 
 
501 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  84.8 
 
 
500 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  84.4 
 
 
500 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  84.4 
 
 
500 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  74.65 
 
 
506 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  76.65 
 
 
501 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  53.57 
 
 
508 aa  521  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  48.81 
 
 
505 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  49.7 
 
 
500 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  49.69 
 
 
497 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  50.41 
 
 
499 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  47.34 
 
 
508 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  47.34 
 
 
508 aa  422  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  47.37 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  45.92 
 
 
512 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  45.98 
 
 
499 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  45.74 
 
 
509 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  48.34 
 
 
506 aa  405  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  45.4 
 
 
477 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  42.03 
 
 
505 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  46.47 
 
 
499 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  46.19 
 
 
499 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  44.53 
 
 
506 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  42.28 
 
 
509 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  42.86 
 
 
508 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  42.89 
 
 
509 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  42.89 
 
 
520 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  44.09 
 
 
507 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  45.17 
 
 
500 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  41.96 
 
 
511 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  41.96 
 
 
511 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  42.62 
 
 
513 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  43.18 
 
 
501 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  43.04 
 
 
491 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  42.19 
 
 
519 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  41.01 
 
 
527 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  42.94 
 
 
526 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  42.39 
 
 
519 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  39.96 
 
 
502 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  41.92 
 
 
501 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  42.94 
 
 
526 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  42.94 
 
 
526 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  42.28 
 
 
509 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  42.94 
 
 
526 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  42.94 
 
 
513 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  42.51 
 
 
513 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  42.39 
 
 
519 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  41.72 
 
 
511 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  42.3 
 
 
513 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  42.3 
 
 
513 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  41.72 
 
 
511 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  40.62 
 
 
512 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.51 
 
 
516 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  40.81 
 
 
512 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  43.79 
 
 
503 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  43.79 
 
 
503 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 
535 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.62 
 
 
510 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  40.58 
 
 
510 aa  360  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  40.52 
 
 
501 aa  358  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  41.29 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  40.9 
 
 
504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  41.29 
 
 
504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  40.7 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.19 
 
 
498 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 
509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  41.07 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  40.62 
 
 
520 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  43.21 
 
 
518 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 
504 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  40.9 
 
 
504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 
504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.69 
 
 
500 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 
504 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.82 
 
 
498 aa  346  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  42.46 
 
 
506 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.82 
 
 
498 aa  343  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  42.98 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  42.98 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 
517 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  43.53 
 
 
518 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  43.53 
 
 
518 aa  339  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>