More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4220 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  64.69 
 
 		 503 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 503 aa  1039    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  47.12 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  47.12 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.12 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.12 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.12 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  47.12 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.12 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.12 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.33 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.91 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.63 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.63 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.63 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.4 
 
 		 498 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.68 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.68 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.41 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.68 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.27 
 
 		 500 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.88 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.47 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.19 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.99 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.29 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.85 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.16 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  41.38 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  40.61 
 
 		 520 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.92 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.92 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  39.72 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.68 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.84 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  40.4 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  39.51 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  39.25 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  38.62 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  39.08 
 
 		 509 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  43.71 
 
 		 439 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.37 
 
 		 500 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  39.44 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.71 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.71 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.71 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.71 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.71 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  39.24 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  39.24 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  37.14 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  38.38 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  36.29 
 
 		 501 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  37.33 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  37.24 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  36.12 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  37.82 
 
 		 505 aa  316  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  37.33 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  38.2 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  35.92 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  36.33 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  36.53 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  36.4 
 
 		 500 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  36.53 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  35.35 
 
 		 502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  37.04 
 
 		 504 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  36.63 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  36.25 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  36.64 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  38 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  35.87 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  39.32 
 
 		 520 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  36.64 
 
 		 504 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  39.08 
 
 		 520 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  39.08 
 
 		 520 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  36.64 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  39.08 
 
 		 520 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  36.64 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  36.64 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  38.06 
 
 		 506 aa  296  6e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  36.55 
 
 		 503 aa  296  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>