More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2012 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  67.68 
 
 		 518 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  66.67 
 
 		 517 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  66.46 
 
 		 520 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  66.26 
 
 		 520 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  67.73 
 
 		 518 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  67.33 
 
 		 518 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  66.46 
 
 		 520 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  66.46 
 
 		 520 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2418  Ppx/GppA phosphatase  67.13 
 
 		 518 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3078  Ppx/GppA phosphatase  76.89 
 
 		 515 aa  742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  100 
 
 		 502 aa  1023    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  43 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  39.59 
 
 		 509 aa  346  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  39.96 
 
 		 513 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.77 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.68 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  40.04 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  40.5 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.57 
 
 		 513 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.37 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.7 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.76 
 
 		 519 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.76 
 
 		 519 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  41.11 
 
 		 526 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  42.3 
 
 		 500 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  41.11 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  41.11 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  41.11 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  41.11 
 
 		 513 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  39.57 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  39.43 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  42.17 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  39.84 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  40.64 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  38.95 
 
 		 508 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  39.96 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.83 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  41.28 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  39.33 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  37.53 
 
 		 500 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  39.92 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  43.04 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  40.74 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  40.55 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.55 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  41.04 
 
 		 500 aa  316  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.51 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.74 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  40.73 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  37.84 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  41.61 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.05 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.03 
 
 		 498 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.03 
 
 		 498 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.03 
 
 		 498 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 493 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  39.12 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  39.12 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.58 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.12 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.86 
 
 		 500 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.37 
 
 		 500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  38.98 
 
 		 499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.66 
 
 		 495 aa  299  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  40.52 
 
 		 501 aa  295  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  41.71 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  39.24 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  39.14 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  38.97 
 
 		 506 aa  290  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.48 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  37.9 
 
 		 508 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.96 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  39.95 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  34.81 
 
 		 505 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 502 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  38.9 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  38.07 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  38.14 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  39.52 
 
 		 527 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  39.14 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  38.81 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  37.26 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  38.57 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  37.39 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>