More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3214 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3214  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0213985  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4068  Ppx/GppA phosphatase  70.16 
 
 
308 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  70.16 
 
 
308 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3875  Ppx/GppA phosphatase  70.16 
 
 
308 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3927  Ppx/GppA phosphatase  70.16 
 
 
308 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  67.87 
 
 
308 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  69.84 
 
 
308 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  69.84 
 
 
308 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  69.18 
 
 
308 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  68.21 
 
 
305 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  69.67 
 
 
303 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  68.77 
 
 
311 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  67 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0408  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  68.52 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  66.89 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0462  Ppx/GppA phosphatase  65.44 
 
 
313 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.84 
 
 
497 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.19 
 
 
497 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.48 
 
 
500 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.83 
 
 
498 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  49.48 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.96 
 
 
493 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.96 
 
 
493 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.96 
 
 
493 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.96 
 
 
493 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.62 
 
 
493 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.42 
 
 
495 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 
498 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 
498 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.6 
 
 
498 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.42 
 
 
498 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  46.74 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  46.74 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  46.74 
 
 
494 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  47.77 
 
 
498 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  46.99 
 
 
439 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  40.13 
 
 
509 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  41.67 
 
 
511 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  41.36 
 
 
513 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  41.47 
 
 
509 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  41 
 
 
511 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  41.02 
 
 
513 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  41.02 
 
 
513 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  40.27 
 
 
501 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  43.56 
 
 
506 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  43.56 
 
 
501 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  41.16 
 
 
516 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
526 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
526 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  41.33 
 
 
520 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  39.32 
 
 
505 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
526 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
526 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  41.16 
 
 
519 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  41.16 
 
 
519 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
513 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  41.16 
 
 
519 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  41.14 
 
 
509 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  39.07 
 
 
501 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.67 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
513 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  41.5 
 
 
503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.75 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  41.89 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  40.27 
 
 
501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.75 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  39.86 
 
 
503 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  38.61 
 
 
330 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  42.47 
 
 
500 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.89 
 
 
526 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  39.66 
 
 
500 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  42.24 
 
 
500 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  40 
 
 
500 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  39.19 
 
 
506 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  39.6 
 
 
501 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  37.84 
 
 
508 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  41.41 
 
 
500 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  37.16 
 
 
516 aa  192  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  42.33 
 
 
500 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  37.16 
 
 
508 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  41.22 
 
 
499 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 
499 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  39.19 
 
 
508 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
517 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  37.25 
 
 
308 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  36.15 
 
 
520 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  36.15 
 
 
520 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>