40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2889 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2889  uncharacterized lipoprotein  100 
 
 		 188 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3439  uncharacterized lipoprotein  64.36 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3110  hypothetical protein  64.89 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3641  hypothetical protein  62.7 
 
 		 188 aa  251  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.689119  normal  0.360346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0714  hypothetical protein  51.06 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3720  hypothetical protein  51.06 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3597  hypothetical protein  51.06 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3528  lipoprotein  51.06 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0786  hypothetical protein  51.06 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0815  hypothetical protein  51.06 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0822  hypothetical protein  49.47 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3152  hypothetical protein  51.06 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3811  putative lipoprotein  50 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3111  putative lipoprotein  50.53 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0774  putative lipoprotein  44.68 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2553  putative lipoprotein  42.02 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1081  hypothetical protein  26.04 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000167601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1887  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0710  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3071  hypothetical protein  30.41 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03278  hypothetical protein  23.26 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002704  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3238  hypothetical protein  29.9 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3095  hypothetical protein  29.9 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000982168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1045  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3057  hypothetical protein  29.9 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3267  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.341142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0901  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00248471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1092  hypothetical protein  30.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2880  hypothetical protein  27.75 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0356  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0518  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497712  normal  0.496447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0469  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0475  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000010636  normal  0.521342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0509  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.43664e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3175  Uncharacterized lipoprotein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000125975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00389  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3199  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000111973  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00385  predicted lipoprotein  28.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0946  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>