35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2553 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2553  putative lipoprotein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3439  uncharacterized lipoprotein  46.81 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3110  hypothetical protein  43.62 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3152  hypothetical protein  45.79 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3720  hypothetical protein  45.21 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3528  lipoprotein  45.21 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3597  hypothetical protein  45.21 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0714  hypothetical protein  45.21 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0786  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0815  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0822  hypothetical protein  43.62 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2889  uncharacterized lipoprotein  42.02 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3811  putative lipoprotein  43.09 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3641  hypothetical protein  40.43 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.689119  normal  0.360346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0774  putative lipoprotein  39.36 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3111  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1081  hypothetical protein  24.34 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000167601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0710  putative lipoprotein  25 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002704  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1887  putative lipoprotein  21.39 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03278  hypothetical protein  22.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0901  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00248471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0356  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00389  hypothetical protein  21.83 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00385  predicted lipoprotein  21.83 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3199  hypothetical protein  21.83 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000111973  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0518  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497712  normal  0.496447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3175  Uncharacterized lipoprotein  21.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000125975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0475  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000010636  normal  0.521342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0469  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0509  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.43664e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3071  hypothetical protein  23.16 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3238  hypothetical protein  23.86 
 
 		 192 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3095  hypothetical protein  23.86 
 
 		 192 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000982168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2880  hypothetical protein  23.16 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>