38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1045 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3267  hypothetical protein  94.79 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.341142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3071  hypothetical protein  81.25 
 
 		 192 aa  337  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2880  hypothetical protein  81.77 
 
 		 192 aa  331  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3095  hypothetical protein  82.29 
 
 		 192 aa  330  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000982168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3238  hypothetical protein  82.29 
 
 		 192 aa  330  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3057  hypothetical protein  82.29 
 
 		 192 aa  330  9e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1092  hypothetical protein  84.9 
 
 		 192 aa  304  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3175  Uncharacterized lipoprotein  68.75 
 
 		 192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000125975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0469  hypothetical protein  68.75 
 
 		 192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0509  hypothetical protein  68.75 
 
 		 192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.43664e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0475  hypothetical protein  68.75 
 
 		 192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000010636  normal  0.521342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0356  hypothetical protein  69.27 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0518  hypothetical protein  68.75 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497712  normal  0.496447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3199  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000111973  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00389  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00385  predicted lipoprotein  68.23 
 
 		 192 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0901  hypothetical protein  69.27 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00248471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002704  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03278  hypothetical protein  27.01 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0774  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1887  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0946  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2889  uncharacterized lipoprotein  28.27 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3439  uncharacterized lipoprotein  24.62 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3811  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0786  hypothetical protein  25.57 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3528  lipoprotein  25.99 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0714  hypothetical protein  25.99 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3597  hypothetical protein  25.99 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3720  hypothetical protein  25.99 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0815  hypothetical protein  25.57 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3152  hypothetical protein  25.57 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3110  hypothetical protein  21.03 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3641  hypothetical protein  21.47 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.689119  normal  0.360346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1081  hypothetical protein  25.14 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000167601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0822  hypothetical protein  24.43 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3111  putative lipoprotein  25 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>