More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1422 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1422  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
179 aa  170  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
170 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
182 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
181 aa  168  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
190 aa  167  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
178 aa  167  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
179 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
181 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
175 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
183 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0862  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
180 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.353594  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
175 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
181 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
175 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
176 aa  158  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
175 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
189 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1423  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
177 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0177502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
186 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
190 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
180 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0965  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
193 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.738782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
179 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
188 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
174 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2112  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
176 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0273695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
175 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0706154  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
176 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
182 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
179 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
175 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
184 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
184 aa  151  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
175 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
180 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
172 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.26 
 
 
183 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
176 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
178 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
181 aa  148  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
179 aa  147  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
187 aa  147  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
184 aa  147  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1440  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1856  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.39 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0749  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
174 aa  144  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00900087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
176 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 
179 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0677  putative GAF sensor protein  42.58 
 
 
466 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000194317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  44.85 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
473 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.36 
 
 
195 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1764  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
175 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
182 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
183 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.42 
 
 
183 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.42 
 
 
183 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
682 aa  141  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0566  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
189 aa  141  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0161542  hitchhiker  0.00589759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
190 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
183 aa  140  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>