More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1764 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1764  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  346  9e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
175 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
183 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
183 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
175 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
175 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
175 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
175 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
175 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
176 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
175 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
175 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
181 aa  170  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
176 aa  170  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  49.12 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
190 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
176 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
169 aa  163  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
176 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  45.93 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
177 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
181 aa  158  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
174 aa  158  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
176 aa  157  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
178 aa  157  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
179 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
178 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
179 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
178 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
186 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
178 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
179 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
180 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
179 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
172 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
186 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
181 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
178 aa  154  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0249  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
167 aa  154  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
177 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
183 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
179 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
179 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
186 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
176 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
179 aa  151  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
179 aa  151  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1856  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
174 aa  150  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
190 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
189 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
176 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
180 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1440  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
183 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
189 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3617  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
195 aa  148  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0965  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.738782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
180 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
175 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0706154  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>