More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0473 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  77.14 
 
 
176 aa  277  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2112  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
176 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0273695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1440  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.52 
 
 
183 aa  207  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0862  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
180 aa  195  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.353594  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1856  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
174 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
183 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1422  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
175 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
172 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
183 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
181 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
179 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
186 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
176 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
180 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
174 aa  158  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
181 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
181 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 
175 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
178 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
174 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 
175 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
190 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
181 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
181 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  154  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  154  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
180 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
175 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
175 aa  151  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1764  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
178 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
184 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
183 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
176 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
179 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
181 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1423  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
177 aa  148  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0177502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
178 aa  148  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
179 aa  148  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
176 aa  147  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
182 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
182 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
178 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
175 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
177 aa  147  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
175 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  44.85 
 
 
178 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
178 aa  147  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
180 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
181 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
190 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
182 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
176 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
177 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
178 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  41.42 
 
 
176 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
177 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
190 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>