57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0900 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  100 
 
 
341 aa  694    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  63.53 
 
 
340 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  61.68 
 
 
336 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  66.34 
 
 
346 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  61.24 
 
 
346 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  61.64 
 
 
337 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  61.32 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  63.58 
 
 
336 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  62.54 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.21 
 
 
333 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  57.41 
 
 
360 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  58.2 
 
 
337 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  59.33 
 
 
364 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  57.56 
 
 
358 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  54.46 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  57.67 
 
 
334 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.92 
 
 
333 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  56.67 
 
 
352 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.66 
 
 
327 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  56.07 
 
 
327 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  55.74 
 
 
327 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  49.7 
 
 
339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  53 
 
 
355 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  50.99 
 
 
365 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  50.84 
 
 
358 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  47.84 
 
 
354 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  47.5 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  49.03 
 
 
325 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  40.98 
 
 
340 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  43.65 
 
 
305 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  38.12 
 
 
338 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  39.82 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.42 
 
 
302 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.42 
 
 
302 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.78 
 
 
302 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.42 
 
 
297 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  40.25 
 
 
322 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  35.87 
 
 
325 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  38.85 
 
 
307 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  32.31 
 
 
320 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  32.05 
 
 
336 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.76 
 
 
476 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  31.03 
 
 
517 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  31.03 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  31.25 
 
 
425 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  30.36 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  31.03 
 
 
517 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  31.03 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  31.03 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  31.03 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
527 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.35 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  30.36 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  30.17 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  29.46 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  29.46 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>