56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2251 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  100 
 
 
339 aa  690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  56.11 
 
 
337 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  56.77 
 
 
337 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.78 
 
 
333 aa  364  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  57 
 
 
360 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  54.34 
 
 
340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.63 
 
 
336 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  51.86 
 
 
336 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  54.97 
 
 
346 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  53.59 
 
 
346 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  49.7 
 
 
341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  48.55 
 
 
352 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  50.16 
 
 
358 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  48.04 
 
 
336 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  49.67 
 
 
354 aa  322  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  50 
 
 
364 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  49.5 
 
 
334 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.01 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.01 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  48.16 
 
 
354 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  45.65 
 
 
327 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  47.33 
 
 
355 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  46.08 
 
 
337 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  47.02 
 
 
327 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  47.99 
 
 
358 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  45.75 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  47.35 
 
 
318 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  42.02 
 
 
340 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  43.75 
 
 
325 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  42.21 
 
 
305 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  38.8 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.13 
 
 
297 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.83 
 
 
302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.83 
 
 
302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.19 
 
 
302 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  40 
 
 
322 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  34.13 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  37.18 
 
 
307 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  32.69 
 
 
325 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  28.85 
 
 
320 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.72 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  37.84 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  37.84 
 
 
425 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  37.84 
 
 
425 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 
527 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  37.84 
 
 
425 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  37.84 
 
 
425 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  36.94 
 
 
476 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  36.04 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  35.14 
 
 
519 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  35.14 
 
 
517 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  35.14 
 
 
519 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  35.14 
 
 
433 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  35.14 
 
 
517 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  34.23 
 
 
433 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.89 
 
 
238 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>