50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8071 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  100 
 
 		 346 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  76.15 
 
 		 346 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  67.19 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  62.5 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  62.27 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  61.24 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  62.22 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  62.75 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  59.27 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  57.23 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  56.92 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.06 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  59.49 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  61.59 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  60.93 
 
 		 354 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  56.95 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  50.93 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  58.94 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  51.16 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  55.37 
 
 		 358 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  53.61 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  55.52 
 
 		 327 aa  351  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  54.55 
 
 		 318 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.87 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  54.55 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  52.6 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  54.97 
 
 		 339 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  50.81 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  42.76 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  44.19 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  42.62 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  40 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.71 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.71 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.06 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.29 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  38.44 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  34.43 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  39.75 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  30.3 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  34.43 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.79 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  29.46 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  30.36 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  31.4 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.06 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  28.57 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  28.57 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  29.06 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>