42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1878 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  59.42 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  53.47 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  50.65 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  51 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  50.81 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  46.71 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  49.38 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  48.44 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  49.5 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  50.5 
 
 		 354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  49.51 
 
 		 346 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  48.68 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  47.6 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  48.11 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.17 
 
 		 336 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  47.51 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  47.49 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.01 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.01 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  47.35 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  48.16 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  47.51 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  43.41 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  43.96 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  43.43 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  43.75 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  39.55 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  37.91 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  36.27 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  37.66 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.78 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.78 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.78 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  38.73 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  37.86 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  32.5 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  36.92 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  32.25 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  31.6 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.17 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>