53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3120 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  100 
 
 		 354 aa  714    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  70.87 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  62.34 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  62.54 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  60.71 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  61.04 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  60.32 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.54 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  60.86 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  58.47 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  57.62 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  60.93 
 
 		 346 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  58.75 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  51.28 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.25 
 
 		 333 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  54.13 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.67 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.18 
 
 		 333 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  53.18 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  52.46 
 
 		 327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  52.46 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  52.46 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  51.33 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  52.98 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  49.67 
 
 		 339 aa  322  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  46.13 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  50.17 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  50.5 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  42.16 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  41.25 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  39.54 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  40.46 
 
 		 376 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.72 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  41.05 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  39.55 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  39.55 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.91 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  40.06 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  34.09 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  30.07 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.65 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  33.93 
 
 		 517 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  33.93 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  33.93 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  33.93 
 
 		 517 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  33.04 
 
 		 476 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  33.93 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  33.93 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.67 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  33.04 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  29.46 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  30.36 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 		 527 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>