45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3412 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  100 
 
 
336 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  70.87 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  62.91 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  64.42 
 
 
337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  68.81 
 
 
346 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  65.29 
 
 
337 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  66.12 
 
 
336 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  62.5 
 
 
346 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  61.68 
 
 
341 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  61.77 
 
 
360 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  58.64 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  60.98 
 
 
334 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.1 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  56.16 
 
 
336 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  56.77 
 
 
358 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  56.59 
 
 
352 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  53.35 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.62 
 
 
333 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  56.11 
 
 
364 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  56.07 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  55.74 
 
 
327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  54.43 
 
 
318 aa  352  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  51.86 
 
 
339 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  51.52 
 
 
358 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  52.7 
 
 
355 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  50.15 
 
 
354 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  49.33 
 
 
365 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  48.44 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  41.3 
 
 
340 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  42.57 
 
 
338 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  42.58 
 
 
305 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  41.78 
 
 
376 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.72 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.72 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.39 
 
 
302 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.07 
 
 
297 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  40.19 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  39.3 
 
 
307 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  33.12 
 
 
320 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  31.94 
 
 
325 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.1 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.81 
 
 
238 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  30.97 
 
 
425 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  30.97 
 
 
425 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 
527 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>