56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2981 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  100 
 
 		 340 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  69.13 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  67.19 
 
 		 346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  62.91 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  66.34 
 
 		 337 aa  427  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  65.8 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  63.53 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  63.46 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  62.34 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  62.34 
 
 		 354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  59.21 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  58.88 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  61.46 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  58.31 
 
 		 334 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  61.46 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.61 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  57.27 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  57.33 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  54.34 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  48.46 
 
 		 333 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  57.52 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  54.85 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  57.84 
 
 		 327 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  53.31 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  53.82 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  51.82 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  49.37 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  49.38 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  42.51 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  42.36 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  44.01 
 
 		 305 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.63 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  42.63 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  41.18 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.99 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  41.48 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  40.5 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  36.28 
 
 		 325 aa  216  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  34.09 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  39.17 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  31.27 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.42 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  30.97 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 		 425 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.97 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  29.2 
 
 		 433 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  29.2 
 
 		 519 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  29.2 
 
 		 517 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  29.2 
 
 		 433 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  29.2 
 
 		 517 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  29.2 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  29.2 
 
 		 433 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>