43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3553 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  100 
 
 
327 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  96.02 
 
 
327 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  96.33 
 
 
327 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  59.55 
 
 
337 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  58.92 
 
 
337 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  55.03 
 
 
336 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.88 
 
 
336 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  52.5 
 
 
333 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  55.76 
 
 
340 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  53.35 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  55.66 
 
 
360 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  55.48 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  54.35 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  54.55 
 
 
334 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  54.23 
 
 
346 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  54.85 
 
 
358 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.94 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  55.03 
 
 
337 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  52.46 
 
 
354 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  51.84 
 
 
364 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  51.99 
 
 
352 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  49.84 
 
 
318 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  49.16 
 
 
358 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  48.99 
 
 
354 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  46.27 
 
 
339 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  46.49 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  44.08 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  48.01 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  41.19 
 
 
340 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  41.8 
 
 
305 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  39.6 
 
 
338 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.19 
 
 
297 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  35.86 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.57 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.57 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.25 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  38.78 
 
 
307 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  33.33 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  34.86 
 
 
325 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  34.67 
 
 
322 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.53 
 
 
336 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.78 
 
 
238 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  29.36 
 
 
410 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>